| 1 | FC Flora | 66,7% (18) 25,9% (7) 3,7% (1) 3,7% (1) | 27 | 20,4 |
| 2 | Salzburg | 53,1% (17) 40,6% (13) 6,2% (2) | 32 | 22,2 |
| 3 | HJK Helsinki | 47,9% (23) 33,3% (16) 6,2% (3) 4,2% (2) | 48 | 22,5 |
| 4 | Minsk | 35,7% (10) 53,6% (15) 3,6% (1) 3,6% (1) | 28 | 22,9 |
| 5 | M. Tel Aviv | 35,1% (13) 37,8% (14) 16,2% (6) 5,4% (2) | 37 | 24,3 |
| 6 | Dinamo Batumi | 28,6% (8) 46,4% (13) 17,9% (5) 3,6% (1) | 28 | 24,3 |
| 7 | FC Twente | 24,1% (7) 62,1% (18) 3,4% (1) 10,3% (3) | 29 | 24,3 |
| 8 | Y.B. Bern | 27,0% (10) 62,2% (23) 8,1% (3) 2,7% (1) | 37 | 24,4 |
| 9 | Lugano | 26,3% (10) 57,9% (22) 13,2% (5) 2,6% (1) | 38 | 24,4 |
| 10 | Larne FC | 32,3% (10) 45,2% (14) 12,9% (4) 3,2% (1) | 31 | 24,4 |
| 11 | P. Belgrad | 38,1% (16) 35,7% (15) 23,8% (10) 2,4% (1) | 42 | 24,5 |
| 12 | Bodö/Glimt | 25,0% (7) 60,7% (17) 14,3% (4) | 28 | 24,7 |
| 13 | Midtjylland | 33,3% (12) 38,9% (14) 22,2% (8) 2,8% (1) | 36 | 24,7 |
| 14 | Fenerbahce | 40,4% (21) 30,8% (16) 21,2% (11) 7,7% (4) | 52 | 24,8 |
| 15 | Dynamo Kiev | 16,7% (6) 61,1% (22) 19,4% (7) 2,8% (1) | 36 | 24,8 |
| 16 | Bialystok | 23,5% (8) 58,8% (20) 14,7% (5) 2,9% (1) | 34 | 24,9 |
| 17 | Slavia Prag | 26,3% (10) 47,4% (18) 21,1% (8) 2,6% (1) | 38 | 24,9 |
| 18 | KF Ballkani | 18,2% (6) 54,5% (18) 12,1% (4) 6,1% (2) | 33 | 24,9 |
| 19 | St. Gilloise | 24,2% (8) 63,6% (21) 6,1% (2) 6,1% (2) | 33 | 24,9 |
| 20 | Sparta Prag | 14,3% (5) 71,4% (25) 14,3% (5) | 35 | 25,1 |
| 21 | Gl. Rangers | 26,5% (9) 44,1% (15) 20,6% (7) 2,9% (1) | 34 | 25,2 |
| 22 | D. Zagreb | 36,1% (13) 36,1% (13) 22,2% (8) 5,6% (2) | 36 | 25,2 |
| 23 | R. S. Belgrad | 22,2% (8) 50,0% (18) 25,0% (9) 2,8% (1) | 36 | 25,4 |
| 24 | Egnatia | 10,3% (3) 72,4% (21) 10,3% (3) 6,9% (2) | 29 | 25,5 |
| 25 | Lille | 30,3% (10) 36,4% (12) 18,2% (6) 15,2% (5) | 33 | 25,6 |
| 26 | Steaua | 16,1% (5) 54,8% (17) 25,8% (8) 3,2% (1) | 31 | 25,6 |
| 27 | Malmö FF | 25,8% (8) 38,7% (12) 29,0% (9) 3,2% (1) | 31 | 25,7 |
| 28 | FC Petrocub | 16,0% (4) 52,0% (13) 20,0% (5) 12,0% (3) | 25 | 25,9 |
| 29 | Hamrun Spart | 33,3% (10) 30,0% (9) 13,3% (4) 13,3% (4) | 30 | 25,9 |
| 30 | Banja Luka | 23,1% (9) 43,6% (17) 28,2% (11) 5,1% (2) | 39 | 25,9 |
| 31 | Galatasaray | 23,5% (8) 44,1% (15) 23,5% (8) 5,9% (2) | 34 | 26,1 |
| 32 | Differdingen | 21,4% (6) 46,4% (13) 25,0% (7) 3,6% (1) | 28 | 26,1 |
| 33 | Vik. Reykjav | 28,1% (9) 25,0% (8) 15,6% (5) 18,8% (6) | 32 | 26,1 |
| 34 | Celje | 18,8% (6) 43,8% (14) 31,2% (10) 3,1% (1) | 32 | 26,2 |
| 35 | Apoel FC | 25,6% (10) 28,2% (11) 17,9% (7) 17,9% (7) | 39 | 26,4 |
| 36 | Sta Coloma | 8,3% (3) 47,2% (17) 25,0% (9) 2,8% (1) | 36 | 26,4 |
| 37 | Klaksvik | 17,2% (5) 48,3% (14) 24,1% (7) 10,3% (3) | 29 | 26,5 |
| 38 | SK SLovan | 19,4% (6) 45,2% (14) 22,6% (7) 9,7% (3) | 31 | 26,5 |
| 39 | Shamrock | 15,8% (6) 31,6% (12) 28,9% (11) 5,3% (2) | 38 | 26,5 |
| 40 | Riga FC | 18,8% (6) 37,5% (12) 25,0% (8) 9,4% (3) | 32 | 26,6 |
| 41 | Llansantffraid | 15,8% (6) 34,2% (13) 23,7% (9) 5,3% (2) | 38 | 26,6 |
| 42 | Ferencvárosi | 8,6% (3) 57,1% (20) 28,6% (10) 5,7% (2) | 35 | 27,0 |
| 43 | FC Struga Trim | 14,3% (4) 35,7% (10) 25,0% (7) 14,3% (4) | 28 | 27,1 |
| 44 | Karabakh | 3,3% (1) 53,3% (16) 36,7% (11) 3,3% (1) | 30 | 27,2 |
| 45 | Ludogorets | 3,4% (1) 62,1% (18) 27,6% (8) 6,9% (2) | 29 | 27,3 |
| 46 | Ekranas | 16,7% (5) 36,7% (11) 30,0% (9) 16,7% (5) | 30 | 27,4 |
| 47 | FK Decic Tuzi | 7,4% (2) 40,7% (11) 7,4% (2) 18,5% (5) | 27 | 27,6 |
| 48 | PAOK Saloniki | 15,2% (5) 30,3% (10) 42,4% (14) 12,1% (4) | 33 | 28,2 |
| 49 | Lincoln FC | 16,2% (6) 27,0% (10) 27,0% (10) 16,2% (6) | 37 | 28,3 |
| 50 | Ordabassy | 33,3% (2) 66,7% (4) | 6 | 29,2 |
| 51 | Pjunik | 7,4% (2) 22,2% (6) 55,6% (15) 14,8% (4) | 27 | 29,3 |
| 52 | SS Virtus | 42,4% (14) 21,2% (7) 33,3% (11) | 33 | 30,4 |
Champions League-Qualifikation
