| 1 | FC Flora | 55,9% (19) 35,3% (12) 8,8% (3) | 34 | 21,9 |
| 2 | Valmiera FK | 30,8% (8) 65,4% (17) 3,8% (1) | 26 | 22,6 |
| 3 | Genk | 44,4% (16) 44,4% (16) 8,3% (3) 2,8% (1) | 36 | 22,9 |
| 4 | Sturm Graz | 40,0% (14) 54,3% (19) 5,7% (2) | 35 | 22,9 |
| 5 | SSC Farul | 46,8% (22) 31,9% (15) 19,1% (9) 2,1% (1) | 47 | 23,3 |
| 6 | Bananz | 21,1% (4) 68,4% (13) 10,5% (2) | 19 | 23,7 |
| 7 | D. Tiflis | 23,3% (7) 40,0% (12) 10,0% (3) | 30 | 23,7 |
| 8 | P. Tirana | 33,3% (11) 54,5% (18) 9,1% (3) 3,0% (1) | 33 | 23,9 |
| 9 | BATE | 30,0% (9) 40,0% (12) 10,0% (3) 3,3% (1) | 30 | 24,0 |
| 10 | KS Rakow Czest | 31,4% (16) 52,9% (27) 15,7% (8) | 51 | 24,0 |
| 11 | D. Zagreb | 37,5% (21) 42,9% (24) 14,3% (8) 3,6% (2) | 56 | 24,2 |
| 12 | Y.B. Bern | 28,9% (11) 60,5% (23) 5,3% (2) 5,3% (2) | 38 | 24,5 |
| 13 | Zalgiris | 32,0% (8) 52,0% (13) 8,0% (2) 8,0% (2) | 25 | 24,5 |
| 14 | Molde | 36,8% (14) 36,8% (14) 23,7% (9) 2,6% (1) | 38 | 24,5 |
| 15 | FK Tsc Backa T | 38,9% (14) 36,1% (13) 19,4% (7) 5,6% (2) | 36 | 24,5 |
| 16 | HJK Helsinki | 40,0% (20) 38,0% (19) 10,0% (5) 10,0% (5) | 50 | 24,6 |
| 17 | Ol. Marseille | 25,0% (12) 54,2% (26) 18,8% (9) 2,1% (1) | 48 | 24,7 |
| 18 | Braga | 35,1% (13) 43,2% (16) 18,9% (7) 2,7% (1) | 37 | 24,7 |
| 19 | O. Ljubljana | 21,9% (7) 62,5% (20) 6,2% (2) 6,2% (2) | 32 | 24,8 |
| 20 | Larne FC | 30,3% (10) 45,5% (15) 15,2% (5) 6,1% (2) | 33 | 24,8 |
| 21 | Antwerpen | 41,9% (13) 29,0% (9) 12,9% (4) 16,1% (5) | 31 | 24,9 |
| 22 | Kopenhagen | 36,6% (15) 31,7% (13) 31,7% (13) | 41 | 25,0 |
| 23 | FK Buducnost | 33,3% (11) 27,3% (9) 12,1% (4) 15,2% (5) | 33 | 25,0 |
| 24 | Sparta Prag | 17,9% (7) 69,2% (27) 10,3% (4) 2,6% (1) | 39 | 25,1 |
| 25 | Genf | 36,1% (13) 33,3% (12) 22,2% (8) 5,6% (2) | 36 | 25,1 |
| 26 | KF Ballkani | 17,9% (5) 57,1% (16) 17,9% (5) 3,6% (1) | 28 | 25,3 |
| 27 | SC Dnipro-1 | 29,0% (9) 35,5% (11) 29,0% (9) 3,2% (1) | 31 | 25,3 |
| 28 | S. Tiraspol | 10,6% (5) 66,0% (31) 2,1% (1) 4,3% (2) | 47 | 25,4 |
| 29 | Shamrock | 23,8% (10) 26,2% (11) 19,0% (8) 4,8% (2) | 42 | 25,5 |
| 30 | Aris Limasso | 31,0% (9) 41,4% (12) 20,7% (6) 3,4% (1) | 29 | 25,5 |
| 31 | Eindhoven | 31,2% (10) 46,9% (15) 12,5% (4) 9,4% (3) | 32 | 25,6 |
| 32 | Gl. Rangers | 25,6% (10) 48,7% (19) 15,4% (6) 7,7% (3) | 39 | 26,0 |
| 33 | Kopavogur | 21,7% (5) 39,1% (9) 30,4% (7) 4,3% (1) | 23 | 26,0 |
| 34 | Galatasaray | 28,3% (13) 41,3% (19) 21,7% (10) 6,5% (3) | 46 | 26,1 |
| 35 | BK Häcken | 40,5% (15) 16,2% (6) 27,0% (10) 16,2% (6) | 37 | 26,2 |
| 36 | M. Haifa | 13,2% (7) 43,4% (23) 18,9% (10) 7,5% (4) | 53 | 26,3 |
| 37 | Ferencvárosi | 14,3% (6) 54,8% (23) 28,6% (12) 2,4% (1) | 42 | 26,4 |
| 38 | Mostar | 17,5% (7) 50,0% (20) 27,5% (11) 5,0% (2) | 40 | 26,4 |
| 39 | Hamrun Spart | 31,4% (11) 28,6% (10) 17,1% (6) 17,1% (6) | 35 | 26,5 |
| 40 | Llansantffraid | 10,0% (3) 30,0% (9) 26,7% (8) | 30 | 26,8 |
| 41 | FC Struga Trim | 17,9% (5) 39,3% (11) 32,1% (9) 3,6% (1) | 28 | 26,9 |
| 42 | AC d`Escaldes | 9,4% (3) 43,8% (14) 21,9% (7) 9,4% (3) | 32 | 27,0 |
| 43 | SK SLovan | 12,1% (4) 48,5% (16) 27,3% (9) 9,1% (3) | 33 | 27,0 |
| 44 | Panathinaikos | 14,9% (7) 38,3% (18) 38,3% (18) 8,5% (4) | 47 | 27,1 |
| 45 | Karabakh | 3,4% (1) 58,6% (17) 31,0% (9) 3,4% (1) | 29 | 27,1 |
| 46 | Klaksvik | 20,7% (6) 37,9% (11) 27,6% (8) 13,8% (4) | 29 | 27,3 |
| 47 | Ludogorets | 2,8% (1) 58,3% (21) 33,3% (12) 5,6% (2) | 36 | 27,4 |
| 48 | AEK Athen | 11,4% (5) 43,2% (19) 38,6% (17) 6,8% (3) | 44 | 27,5 |
| 49 | Astana | 6,2% (2) 50,0% (16) 31,2% (10) 12,5% (4) | 32 | 27,8 |
| 50 | Swift Hesper | 5,9% (2) 41,2% (14) 41,2% (14) 11,8% (4) | 34 | 28,3 |
| 51 | Lincoln FC | 7,4% (2) 33,3% (9) 37,0% (10) 14,8% (4) | 27 | 29,1 |
| 52 | Tre Penne | 10,0% (3) 33,3% (10) 30,0% (9) 26,7% (8) | 30 | 30,1 |
Champions League-Qualifikation
