| 1 | Salzburg | 57,5% (23) 32,5% (13) 2,5% (1) 7,5% (3) | 40 | 22,6 |
| 2 | Alkmaar | 35,9% (14) 53,8% (21) 10,3% (4) | 39 | 23,2 |
| 3 | L. Zagreb | 40,0% (26) 46,2% (30) 10,8% (7) 3,1% (2) | 65 | 23,2 |
| 4 | Dynamo Kiev | 37,1% (23) 51,6% (32) 11,3% (7) | 62 | 23,3 |
| 5 | FC Flora | 38,7% (12) 45,2% (14) 9,7% (3) 6,5% (2) | 31 | 23,4 |
| 6 | NK Celje | 30,0% (6) 55,0% (11) 10,0% (2) | 20 | 23,4 |
| 7 | Rapid Wien | 44,4% (16) 38,9% (14) 11,1% (4) 2,8% (1) | 36 | 23,5 |
| 8 | Celje | 17,4% (4) 78,3% (18) 4,3% (1) | 23 | 23,6 |
| 9 | C. Glasgow | 28,9% (13) 60,0% (27) 11,1% (5) | 45 | 23,8 |
| 10 | D. Zagreb | 31,1% (19) 49,2% (30) 16,4% (10) 3,3% (2) | 61 | 24,0 |
| 11 | Midtjylland | 30,9% (17) 54,5% (30) 10,9% (6) 3,6% (2) | 55 | 24,1 |
| 12 | PAOK Saloniki | 38,0% (19) 40,0% (20) 18,0% (9) 4,0% (2) | 50 | 24,1 |
| 13 | Kuopio PS | 27,9% (12) 53,5% (23) 9,3% (4) 4,7% (2) | 43 | 24,3 |
| 14 | Slavia Prag | 28,6% (14) 59,2% (29) 8,2% (4) 4,1% (2) | 49 | 24,4 |
| 15 | Y.B. Bern | 32,4% (11) 55,9% (19) 5,9% (2) 5,9% (2) | 34 | 24,4 |
| 16 | R. S. Belgrad | 37,2% (16) 34,9% (15) 27,9% (12) | 43 | 24,7 |
| 17 | Besiktas | 37,5% (21) 35,7% (20) 23,2% (13) 3,6% (2) | 56 | 24,8 |
| 18 | M. Tel Aviv | 28,6% (12) 47,6% (20) 21,4% (9) 2,4% (1) | 42 | 25,0 |
| 19 | Ferencvárosi | 24,4% (10) 58,5% (24) 17,1% (7) | 41 | 25,1 |
| 20 | Floriana | 10,0% (1) 80,0% (8) 10,0% (1) | 10 | 25,1 |
| 21 | Djurgardens | 23,7% (9) 47,4% (18) 26,3% (10) 2,6% (1) | 38 | 25,1 |
| 22 | FK Buducnost | 25,9% (7) 37,0% (10) 25,9% (7) | 27 | 25,2 |
| 23 | S. Tiraspol | 14,3% (5) 71,4% (25) 8,6% (3) 5,7% (2) | 35 | 25,3 |
| 24 | Molde | 20,0% (7) 54,3% (19) 25,7% (9) | 35 | 25,5 |
| 25 | Benfica | 17,7% (11) 64,5% (40) 12,9% (8) 4,8% (3) | 62 | 25,5 |
| 26 | D. Tiflis | 26,2% (11) 40,5% (17) 16,7% (7) 2,4% (1) | 42 | 25,6 |
| 27 | Olympiakos | 18,4% (9) 57,1% (28) 16,3% (8) 8,2% (4) | 49 | 25,7 |
| 28 | KAA Gent | 22,2% (10) 55,6% (25) 20,0% (9) 2,2% (1) | 45 | 25,8 |
| 29 | L. Warschau | 30,4% (14) 34,8% (16) 21,7% (10) 13,0% (6) | 46 | 25,8 |
| 30 | SK SLovan | 15,6% (5) 62,5% (20) 21,9% (7) | 32 | 25,8 |
| 31 | Karabakh | 21,2% (7) 45,5% (15) 30,3% (10) 3,0% (1) | 33 | 25,8 |
| 32 | Astana | 23,5% (8) 41,2% (14) 17,6% (6) 5,9% (2) | 34 | 25,9 |
| 33 | FC Ararat-Arme | 19,2% (10) 55,8% (29) 19,2% (10) 5,8% (3) | 52 | 26,0 |
| 34 | Dundalk | 10,8% (4) 59,5% (22) 18,9% (7) 5,4% (2) | 37 | 26,1 |
| 35 | Fola Esch | 23,5% (8) 41,2% (14) 23,5% (8) 11,8% (4) | 34 | 26,1 |
| 36 | FK Rigas Futbo | 15,7% (8) 56,9% (29) 17,6% (9) 9,8% (5) | 51 | 26,2 |
| 37 | Linfield | 21,4% (6) 46,4% (13) 17,9% (5) 10,7% (3) | 28 | 26,3 |
| 38 | Pilsen | 14,3% (5) 57,1% (20) 22,9% (8) 5,7% (2) | 35 | 26,3 |
| 39 | Krasnodar | 22,5% (9) 42,5% (17) 27,5% (11) 7,5% (3) | 40 | 26,3 |
| 40 | Riga FC | 18,5% (10) 50,0% (27) 20,4% (11) 11,1% (6) | 54 | 26,4 |
| 41 | Floriana FC | 100,0% (6) | 6 | 26,5 |
| 42 | Om. Nikosia | 24,3% (9) 37,8% (14) 27,0% (10) 10,8% (4) | 37 | 26,5 |
| 43 | Ludogorets | 7,7% (3) 64,1% (25) 20,5% (8) 5,1% (2) | 39 | 26,6 |
| 44 | Marijampole | 26,5% (9) 38,2% (13) 26,5% (9) 8,8% (3) | 34 | 26,6 |
| 45 | KF Drita | 4,5% (1) 59,1% (13) 36,4% (8) | 22 | 26,6 |
| 46 | FC Europa | 15,0% (3) 40,0% (8) 35,0% (7) 10,0% (2) | 20 | 27,0 |
| 47 | Klaksvik | 12,0% (3) 52,0% (13) 24,0% (6) 8,0% (2) | 25 | 27,1 |
| 48 | FK Sarajevo | 11,1% (2) 50,0% (9) 33,3% (6) 5,6% (1) | 18 | 27,1 |
| 49 | Kratovo | 9,1% (1) 36,4% (4) 45,5% (5) | 11 | 27,2 |
| 50 | Brest | 14,8% (4) 37,0% (10) 29,6% (8) 14,8% (4) | 27 | 27,3 |
| 51 | FK Tirana | 8,3% (2) 70,8% (17) 4,2% (1) 16,7% (4) | 24 | 27,5 |
| 52 | Cluj | 16,4% (9) 41,8% (23) 27,3% (15) 14,5% (8) | 55 | 27,6 |
| 53 | Connah's Quay | 11,5% (3) 34,6% (9) 34,6% (9) 19,2% (5) | 26 | 28,6 |
| 54 | KR Reykjavik | 14,3% (2) 28,6% (4) 28,6% (4) 28,6% (4) | 14 | 28,7 |
| 55 | Tre Fiori | 50,0% (7) 14,3% (2) 35,7% (5) | 14 | 29,9 |
| 56 | Inter Club de | 3,6% (2) 29,1% (16) 14,5% (8) 43,6% (24) | 55 | 31,6 |
Champions League-Qualifikation
