| 1 | Ajax Amsterdam | 65,5% (38) 27,6% (16) 1,7% (1) 5,2% (3) | 58 | 21,7 |
| 2 | Malmö FF | 41,3% (26) 31,7% (20) 4,8% (3) 1,6% (1) | 63 | 21,7 |
| 3 | Pjunik | 52,4% (11) 47,6% (10) | 21 | 21,8 |
| 4 | L. Tallinn | 52,6% (20) 39,5% (15) 7,9% (3) | 38 | 21,8 |
| 5 | D. Zagreb | 56,4% (31) 36,4% (20) 7,3% (4) | 55 | 21,9 |
| 6 | HJK Helsinki | 58,8% (20) 23,5% (8) 14,7% (5) 2,9% (1) | 34 | 22,1 |
| 7 | Midtjylland | 55,3% (21) 31,6% (12) 10,5% (4) 2,6% (1) | 38 | 22,3 |
| 8 | Monaco | 56,2% (27) 33,3% (16) 10,4% (5) | 48 | 22,3 |
| 9 | Trencin | 35,0% (7) 65,0% (13) | 20 | 22,4 |
| 10 | Sparta Prag | 53,1% (26) 32,7% (16) 8,2% (4) 6,1% (3) | 49 | 22,4 |
| 11 | Rapid Wien | 31,0% (9) 55,2% (16) 6,9% (2) 3,4% (1) | 29 | 23,0 |
| 12 | B36 Torshavn | 35,3% (6) 52,9% (9) 11,8% (2) | 17 | 23,0 |
| 13 | Man. United | 45,5% (20) 40,9% (18) 11,4% (5) 2,3% (1) | 44 | 23,0 |
| 14 | BATE | 46,5% (20) 37,2% (16) 16,3% (7) | 43 | 23,1 |
| 15 | Salzburg | 48,6% (18) 35,1% (13) 13,5% (5) 2,7% (1) | 37 | 23,2 |
| 16 | C. Glasgow | 41,0% (16) 41,0% (16) 17,9% (7) | 39 | 23,3 |
| 17 | Sporting | 32,2% (19) 57,6% (34) 10,2% (6) | 59 | 23,3 |
| 18 | Y.B. Bern | 47,2% (17) 33,3% (12) 19,4% (7) | 36 | 23,5 |
| 19 | Lazio Rom | 45,3% (24) 35,8% (19) 18,9% (10) | 53 | 23,5 |
| 20 | KF Skënderbe | 27,3% (3) 63,6% (7) 9,1% (1) | 11 | 23,6 |
| 21 | Valencia | 26,0% (13) 60,0% (30) 14,0% (7) | 50 | 23,7 |
| 22 | FC Basel | 37,1% (13) 48,6% (17) 11,4% (4) 2,9% (1) | 35 | 23,8 |
| 23 | Leverkusen | 40,0% (16) 47,5% (19) 7,5% (3) 5,0% (2) | 40 | 23,8 |
| 24 | Ludogorets | 31,2% (10) 56,2% (18) 12,5% (4) | 32 | 23,8 |
| 25 | P. Belgrad | 36,1% (13) 52,8% (19) 8,3% (3) 2,8% (1) | 36 | 23,8 |
| 26 | Club Brügge | 32,4% (11) 58,8% (20) 5,9% (2) 2,9% (1) | 34 | 23,9 |
| 27 | M. Tel Aviv | 39,5% (15) 42,1% (16) 13,2% (5) 5,3% (2) | 38 | 24,2 |
| 28 | Pljevlja | 22,2% (2) 66,7% (6) 11,1% (1) | 9 | 24,2 |
| 29 | FK Sarajevo | 24,0% (6) 52,0% (13) 20,0% (5) | 25 | 24,2 |
| 30 | Fola Esch | 33,3% (6) 55,6% (10) 11,1% (2) | 18 | 24,3 |
| 31 | Maribor | 31,6% (12) 44,7% (17) 18,4% (7) 5,3% (2) | 38 | 24,3 |
| 32 | Zalgiris | 25,7% (9) 54,3% (19) 17,1% (6) | 35 | 24,8 |
| 33 | Panathinaikos | 15,6% (5) 65,6% (21) 15,6% (5) 3,1% (1) | 32 | 24,8 |
| 34 | Shakhtar | 29,7% (19) 45,3% (29) 18,8% (12) 3,1% (2) | 64 | 24,9 |
| 35 | Lincoln FC | 28,6% (6) 42,9% (9) 19,0% (4) 9,5% (2) | 21 | 24,9 |
| 36 | Poznan | 40,6% (13) 34,4% (11) 21,9% (7) 3,1% (1) | 32 | 24,9 |
| 37 | Fenerbahce | 28,6% (10) 45,7% (16) 22,9% (8) 2,9% (1) | 35 | 25,1 |
| 38 | Apoel FC | 33,3% (13) 33,3% (13) 30,8% (12) 2,6% (1) | 39 | 25,1 |
| 39 | Dundalk | 23,8% (5) 52,4% (11) 14,3% (3) 9,5% (2) | 21 | 25,1 |
| 40 | V. Skopje | 32,0% (8) 40,0% (10) 24,0% (6) 4,0% (1) | 25 | 25,2 |
| 41 | Astana | 13,3% (4) 53,3% (16) 16,7% (5) 3,3% (1) | 30 | 25,3 |
| 42 | Stjarnan | 22,7% (5) 45,5% (10) 27,3% (6) 4,5% (1) | 22 | 25,4 |
| 43 | Pilsen | 29,0% (9) 45,2% (14) 22,6% (7) 3,2% (1) | 31 | 25,5 |
| 44 | Videoton | 13,3% (4) 70,0% (21) 16,7% (5) | 30 | 25,6 |
| 45 | Paola | 36,4% (8) 18,2% (4) 36,4% (8) 9,1% (2) | 22 | 25,6 |
| 46 | Ventspils | 20,0% (6) 56,7% (17) 13,3% (4) 10,0% (3) | 30 | 25,7 |
| 47 | Karabakh | 11,5% (3) 65,4% (17) 19,2% (5) 3,8% (1) | 26 | 25,8 |
| 48 | Steaua | 14,3% (5) 65,7% (23) 17,1% (6) 2,9% (1) | 35 | 26,1 |
| 49 | Orhei | 15,8% (3) 57,9% (11) 26,3% (5) | 19 | 26,2 |
| 50 | Crusaders | 9,1% (1) 54,5% (6) 27,3% (3) | 11 | 26,5 |
| 51 | FC Dila Gori | 20,0% (2) 40,0% (4) 30,0% (3) 10,0% (1) | 10 | 26,6 |
| 52 | Folgore | 64,3% (9) 28,6% (4) 7,1% (1) | 14 | 26,9 |
| 53 | Santa Coloma | 25,0% (1) 50,0% (2) 25,0% (1) | 4 | 27,0 |
| 54 | Llansantffraid | 69,2% (9) 30,8% (4) | 13 | 27,1 |
| 55 | Molde | 31,2% (15) 31,2% (15) 4,2% (2) 8,3% (4) | 48 | 27,4 |
| 56 | ZSKA Moskau | 19,4% (6) 41,9% (13) 19,4% (6) 19,4% (6) | 31 | 27,5 |
| 57 | Sta Coloma | 16,0% (4) 44,0% (11) 24,0% (6) 16,0% (4) | 25 | 27,8 |
| 58 | Korça | 8,6% (3) 25,7% (9) 11,4% (4) 5,7% (2) | 35 | 27,9 |
Champions League-Qualifikation
